Az agyalapi mirigy az agykoponya középső részén található csontos üregben, az ún. "töröknyeregben" elhelyezkedő, kb. nagyborsónyi szerv, amely egy nyél segítségével a központi idegrendszer egyik fontos területéről, a hipotalamuszról csüng le. Közvetlenül felette helyezkednek el az egyik fontos agyideg, a látóideg kereszteződő rostjai. Az agyalapi mirigynek emberben két lebenye van, az ún. elülső és hátsó lebeny.